Truyện tác giả: Lông Vũ Tản Tác Rơi

Trong một đêm bí ẩn, tư liệu quan trọng về Haibara Ai đã biến mất, bao gồm cả người thật của cô. Bác tiến sĩ Mori không biết chuyện gì đã xảy ra, chỉ biết người FBI đã mang bé Ai đi với người phụ nữ nước ngoài Jodie và một người bảo đảm an toàn. Conan, người đã khuyên bé Ai rời đi, đã từ chối FBI và quyết định tự mình bảo vệ Mori Kogoro, người đã trở thành trung tâm của vụ án. Tuy nhiên, Conan không thể chắc chắn về vị trí của mình trong mắt Tổ chức Áo đen, và cũng không biết họ đã nghi ngờ mình hay chưa. Nếu FBI điều động người bảo vệ, Tổ chức sẽ nghĩ Conan và FBI có quan hệ, và nếu bản thân Conan bị điều tra, người của Tổ chức sẽ nghe lén. Do đó, Mori, Ran và đội thám tử nhí của Conan đều sẽ gặp nguy hiểm. Conan không khỏi nghĩ đến buổi tối hôm đó, khi Haibara đã nói với cậu một câu bí ẩn: "Kudo, có thể cậu không biết, cậu đã thâm nhập quá sâu vào Tổ chức, và chúng ta đã bắt đầu một kế hoạch bí mật." Câu nói đó đã làm Conan lo lắng, và cậu biết rằng cuộc chơi đuổi bắt đã bắt đầu.